Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpreP49446 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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