Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LmnaP48678 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LmnaP48678 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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