Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VdrP48281 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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