Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx1-2P42580 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms