Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sept1P42209 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sept1P42209 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms