Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TtlP38585 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TtlP38585 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TtlP38585 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms