Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab20P35295 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab20P35295 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms