Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Apoc1P34928 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms