Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pabpc1P29341 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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