Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RxrgP28705 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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