Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NapbP28663 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NapbP28663 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NapbP28663 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NapbP28663 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms