Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
U2af2P26369 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
U2af2P26369 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms