Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nfkb1P25799 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms