Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms