Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou5f1P20263 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms