Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tnnc1P19123 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms