Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
P18529 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
P18529 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
P18529 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms