Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Hoxb1P17919 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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