Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PcnaP17918 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcnaP17918 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms