Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtaP09225 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtaP09225 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms