Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms