Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Spta1P08032 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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