Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
TtrP07309 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
TtrP07309 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
TtrP07309 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms