Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06323 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06323 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06323 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06323 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P06323 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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