Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04212 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04212 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04212 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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