Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01812 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01812 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01812 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms