Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sp1O89090 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms