Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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CcnkO88874 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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CcnkO88874 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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CcnkO88874 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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CcnkO88874 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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CcnkO88874 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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