Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Copb2O55029 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Copb2O55029 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Copb2O55029 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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