Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sdc4O35988 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sdc4O35988 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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