Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cited2O35740 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms