Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih1O35372 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms