Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Slc18a3O35304 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Slc18a3O35304 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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