Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Casq1O09165 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms