Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MttpO08601 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MttpO08601 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms