Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm17078M0QW51 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms