Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm9602J3QPD5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm9602J3QPD5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms