Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm2035J3QP87 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms