Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms