Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lipo1J3QME6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms