Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21818J3KMS6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms