Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20828J3KMI7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms