Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn20G5E8X0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn20G5E8X0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn20G5E8X0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Cldn20G5E8X0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn20G5E8X0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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