Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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