Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm28048F7BCN0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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