Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm340F6RGI3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm340F6RGI3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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