Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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