Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo5cE9Q1F5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms