Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms