Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Samd1D3YXK1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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